Los investigadores han observado que los manatíes también viven en zonas donde existen plantas capaces de aumentar la temperatura del agua. Esta información es muy importante ya que cuando estas plantas rodean a los manatíes, estos pueden morir debido a los cambios bruscos que experimentan en el agua.
Aunque los manatíes son solitarios, no tienen problemas para vivir junto a otro manatí que se encuentren. Ellos se saludan o se comunican con chirridos, sin haber indicios de agresión por ocupar el territorio. Hay muchos animales como las tortugas, los tiburones pequeños, lenguados y ostras que viven en zonas donde habita el manatí, pues no representa peligro alguno para ellos al ser un animal herbívoro.
De igual forma, aquellos que viven en aguas dulces, comparten el hábitat con, nutrias, tortugas, ranas, caracoles y moluscos, cuyas poblaciones pueden reducirse en determinadas épocas del año dependiendo de la cantidad de alimento disponible y la ubicación.

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